Στον εξοπλισμό του τμήματος, πέραν των ηλεκτρονικών υπολογιστών στη γραμματεία του Κέντρου, και των οπτικοακουστικών μέσων εκπαίδευσης συμπεριλαμβάνονται το εργαστήριο βασικής έρευνας και μοριακών αναλύσεων όπου διενεργούνται οι γονιδιακές αναλύσεις των ασθενών με Ιστιοκυττάρωση εκ κυττάρων Langerhans (διερεύνηση-ταυτοποίηση των σωματικών μεταλλάξεων του γονιδίου BRAF).

Επιπλέον, Το 251 ΓΝΑ διαθέτει Νοσοκομειακό Πληροφοριακό Σύστημα, στο οποίο καταγράφονται δεδομένα του ασθενή, υποσύστημα διαχείρισης διαγνωστικών εργαστηρίων και υποσύστημα διαχείρισης φαρμάκου.