Το Κέντρο ακολουθεί με συνέπεια τις διαδικασίες διαφύλαξης της ακεραιότητας και προστασίας των προσωπικών δεδομένων των ασθενών, με κωδικοποίηση των νεοπλασμάτων και των ίδιων ασθενών, και αποφυγή τυχόν συγκρουόμενων συμφερόντων. Για την προστασία των προσωπικών δεδομένων υπεύθυνο (Data Protection Officer) είναι το Τμήμα Προστασίας Προσωπικών Δεδομένων του Υπουργείου Εθνικής άμυνας.

Ακολουθούνται επιμελώς οι οδηγίες ορθής πρακτικής της ιατρικής, κανόνων υγιεινής, ωραρίου και ασφάλειας και όλων εκείνων των δεδομένων εύρυθμης λειτουργίας ενός τμήματος που λειτουργεί στα πλαίσια οργάνωσης και λειτουργίας του 251 ΓΝΑ.